http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/static/19446223720118205527863/
所有文章：http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/#m=0
1. 成对HMM用于双序列比对的基本思想：
2. 状态转移矩阵：
3. 成对HMM的完整描述：
4. 成对HMM的Viterbi算法：
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2. 状态转移矩阵：
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